竹笛和长笛作为两种常见的吹奏乐器，虽然都能演奏出美妙的音乐，但在诸多方面存在着明显的区别。
长笛通常由普通型无缝镍银管或专业型硬质真银制成，其结构包括管身（含吹节、主节、尾节）和音键系统，通过机械传动的按钮堵住不同的 16 孔来发音。竹笛则一般为竹制，是一根比手指略粗的长管，上面开有若干小孔，靠堵住 7 孔发出全音，半音靠堵半孔发音。
长笛作为吹孔气鸣乐器，被广泛应用于现代管弦乐队，有时也用于军乐，且常用于独奏、重奏。竹笛是中国古老且具代表性的吹奏乐器，也是中国传统音乐中常用的横吹木管乐器之一，在中国传统音乐中具有重要地位，其常见类型有南方的曲笛、北方的梆笛和介于两者之间的中音笛。
长笛属于管弦乐队木管组中的高音乐器，音色优美，音域宽广，奏法繁多，表现力丰富，与弦乐、木管、铜管乐器亲和力强。竹笛的音色不但丰富多样，且种类繁多，形成了风格迥异的南北两派。但整体而言，竹笛的音色相对更为高亢明亮。
竹笛的技法相较长笛更为丰富和花哨，而长笛的基本技法较少，但对气息控制的要求很高。
长笛主要配合钢琴、小提琴等乐器；竹笛则主要配合二胡、古琴、古筝等。
竹笛由竹子制作，不容易保养，价格相对较低，初级竹笛一套价格约在 1000 元左右，顶级竹笛约上万元。长笛一般由金属制成，有银质或纯金的，一支初级长笛价格约 3000 元，顶级长笛可达 50 万元左右。
长笛和竹笛在指法运作上有一定相似性，但仍存在较大差异。长笛上可以任意演奏任何调的指法，但对演奏者的操作熟练度要求较高。竹笛则在某些特定指法上有其独特之处。
总之，竹笛和长笛各有特点，选择学习和演奏哪种乐器，取决于个人的兴趣、音乐风格偏好以及实际需求。